Introduction to Bioinformatics

Description

Schedule

Klik hier voor het huidige rooster van deze cursus.

Goals

Bioinformatica is het omgaan met de grote hoeveelheid kennis van ons erfelijk materiaal (DNA) en de functies van die eiwitten gecodeerd in dat DNA. Deze informatie wordt opgeslagen in vele grote databanken. Met behulp van technieken uit informatica kunnen antwoorden gezocht worden voor chemische, biologische en biomedische vragen. Het doel van de cursus is om een aantal bioinformatica principes duidelijk te maken welke ten grondslag liggen aan een aantal belangrijke technieken zoals genoomanalyse en homologie modeleren. Deze principes zijn: homologie, WWW-gebruik, databases, eiwit sequentie analyse.

Subjects

1. Introductie Bioinformatica
2. Data en databases (eiwitsequentie, nucleinezuursequentie, eiwitstructuur)
3. Sequentie analyse tools
4. De aminozuren & hun eigenschappen
5. De aminozuren in hun natuurlijke omgeving
6. Alignen van sequenties
7. Maken van je eigen alignment programma
8. Real-world voorbeelden
9. Clusteren van sequenties
10. Multiple sequence alignment

Na afloop van Bioinformatica I begrijpen de studenten de onderliggende principes van eiwit sequentie alignments en andere eiwit sequentie analyse mogenlijkheden, en kunnen ze deze ook toepassen in de alledaagse biochemische, biomedische en moleculair biologische praktijk. Op het web is nog meer informatie beschikbaar over dit vak.

Examination and grading

Schriftelijke tussentoets en schriftelijk tentamen. Aanwezigheid en aktieve deelname tellen mee in de beoordeling.

Literature

• Reader, wordt uitgereikt tijdens cursus.
• Exercise Book, wordt uitgereikt tijdens cursus.

Details

Dit vak wordt gegeven voor alle 2e jaars studenten uit het cluster MW en andere belangstellenden.