Het internet

Het internet speelt een centrale rol in de bioinformatica. Niet alleen gebruiken we het internet om jullie vandaag een heel klein beetje aan het internet te laten snuffelen, maar je kunt ook heel erg veel data vinden. Er zijn zoveel databases die nuttig zijn in de biologie/scheikunde/etc dat er nu al databases bestaan die alle databases tonen die gespecialiseerd zijn in het tonen van databases.

Het zal duidelijk zijn dat de bioinformatica studie tijd besteed aan het zoeken naar en in databases!

Een aantal databases

Deze lijst bevat een aantal pointers naar verschillende databases. Probeer door gewoon een beetje rond te klikken uit te vinden wat voor informatie in deze databases zit. Bij elke database zit een specifieke vraag.

  1. PDB. Wat is de functie van het eiwit crambin?
  2. SCOP. ROP is een 'all alpha' eiwit (dwz er zitten veel helices in, en geen strands). Van hoeveel verschillende species kennen we al de struktuur van een ROP molecuul?
  3. PubMed. Kun je de artikelen vinden die Gert Vriend in 1999 gepubiceerd heeft?
  4. SwissProt. Welke sequentie heeft accession code P01542?
  5. SoyBase. Hoeveel enzymen zijn betrokken bij de synthese van het amino zuur phenylalanine?
  6. Pedro lijst. Dit was de eerste database van databases. Wat is mis met zo'n mooie lijst?
  7. GPCRDB. Wat voor soort eiwit is een GPCR eigenlijk? Hoe ziet het er uit? Wat doet het? Waar zitten ze allemaal in jouw lichaam denk je?